Guia docente 2023_24
Escuela de Ingeniería Industrial
Máster Universitario en Enxeñaría Biomédica
 Materias
  Modelado e simulación sistemas biomédicos
   Contidos
Tema Subtema
1. Introdución ao modelado matemático en biomedicina 1.1. Motivación e historia dos modelos en biomedicina
1.2. Modelado dinámico: compoñentes e paradigmas
1.3. Tipos de modelos dinámicos
1.3.1. Grafos
1.3.2. Ecuacións diferenciais
1.4. Combinacións de modelos
1.5. Exemplos
2. Sistemas dinámicos biomédicos e formalismos para o seu modelado 2.1. Tipos de biosistemas de interese
2.2. Cinética das reaccións bioquímicas
2.3. Nivel celular
2.3.1. Metabolismo
2.3.2. Sinalización celular
2.3.3. Expresión xénica
2.4. Nivel orgánico
2.4.1. Electrofisioloxía
2.4.2. Regulación da glicosa
2.4.3. Farmacocinética e farmacodinámica
2.5. Nivel de poboacións
2.5.1. Epidemioloxía
2.5.2. Comunidades microbianas
3. Métodos numéricos de simulación 3.1. Integración de ecuacións diferenciais ordinarias lineares
3.1.1. Transformada de Laplace
3.1.2. Función de transferencia
3.2. Integración de ecuacións diferenciais ordinarias nonlineares
3.2.1. Métodos de paso fixo
3.2.2. Métodos de paso variábel
3.3. Integración de ecuacións estocásticas
3.3.1. Algoritmo de Gillespie
3.4. Software de simulación
3.4.1. Entornos de programación de propósito xeral
3.4.2. Ferramentas de simulación especializadas
3.5. Estándares, formatos e repositorios
4. Construción de modelos e identificación de sistemas 4.0. PASO 0: obter as ecuacións do modelo
4.1. PASO 1: analizar observabilidade e identificabilidade estrutural
4.2. PASO 2: definir a función obxectivo
4.3. PASO 3: optimización dos parámetros
4.3.1. Métodos locais
4.3.2. Métodos globais
4.3.3. Definición do problema de optimización
4.4. PASO 4: análise da bondade do axuste
4.5. PASO 5: cuantificación da incerteza dos parámetros
4.6. PASO 6: cuantificación da incerteza nas predicións
4.7. Deseño de experimentos
4.8. Selección de modelos
4.9. Recursos software
5. Comportamento dinámico 5.1. Equilibrio e estabilidade
5.1.1. Caracterización matemática da estabilidade
5.2. Bifurcacións
5.3. Oscilacións
5.4. Robustez
5.4.1. Redundancia
5.4.2. Insensibilidade paramétrica
5.4.3. Realimentación
5.4.4. Prealimentación
5.5. Redución de modelos
Universidade de Vigo            | Rectorado | Campus Universitario | C.P. 36.310 Vigo (Pontevedra) | España | Tlf: +34 986 812 000