Modelos de evolución molecular. |
Saturación. Probabilidad de cambio. Modelos de sustitución nucleotídica. Test de la razón de verosimilitudes. Criterio de información de Akaike. Selección Bayesiana. Inferencia multimodelo. |
Máxima parsimonia |
Criterio de parsimonia. Parsimonia de Wagner y Fitch. Reconstrucción de estados ancestrales más parsimoniosos. Parsimonia de Dollo. Parsimonia de Camin y Sokal. Parsimonia generalizada. Índices de consistencia y retención. Atracción de las ramas largas. |
Máxima verosimilitud. |
Concepto de verosimilitud. Cálculo de la verosimilitud en árboles. Algoritmo de poda. Reconstrucción de estados ancestrales. Parsimonia y verosimilitud. |
Contrastes filogenéticos. |
Error y confianza filogenética. Comparación de topologías. Reloj molecular. Test de las tasas relativas |