TEMA 1. Introdución ás simulacións computacionais de biomateriales. Evolución histórica e proxección.
TEMA 2. Principais métodos de modelado e simulación. Docking, Montecarlo e Dinámica Molecular.
TEMA 3. Campos de forza e niveis de resolución. Vantaxes e limitacións. Mapeos multiescala.
TEMA 4. Algoritmos e aproximacións. Consideración de forzas de curto e longo alcance, baróstatos, termostatos, condicións periódicas.
TEMA 5. Análise: desviacións e fluctuaciones, perfís de densidade, coeficientes de difusión en 2 e 3 dimensións, funcións de autocorrelación, funcións de distribución radial, etc.
TEMA 6. Métodos de cálculo de enerxías de Gibbs para diferentes procesos.
TEMA 7. Software e hardware: principais ferramentas computacionales e como xestionar recursos de hardware. Motores de cómputo, paquetes de análises e visualizadores.
TEMA 8. Casos prácticos: autoasociación de pequenas moléculas, estudo de agregados supramoleculares, plegamiento- desplegamiento de macromoléculas, micelas e membranas. |
|
