Guia docente 2024_25 Facultad de Biología

Contidos

Tema	Subtema
Tema 1. Ferramentas Unix para a Bioinformática	Entorno Unix e liña de comandos. Servidores remotos. Acceso e manipulación de ficheiros. Expresións regulares. Utilidades e scripts de Bash.
Tema 2. Secuenciación masiva do ADN	Plataformas de secuenciación. Bibliotecas de secuenciación. Cobertura de secuenciación. Formato FASTQ. Control de calidade das lecturas.
Tema 3. Aliñación de secuencias	Concepto de aliñamento. Puntuación. Algoritmos de aliñamento. Mapeo de lecturas secuenciadas. Formatos SAM/BAM. Post-procesamento.
Tema 4. Identificación de variantes xenómicas	Tipos de variantes xenómicas. Identificación. Métodos de identificación. Formato VCF. Variación estructural. Filtrado. Anotación.
Tema 5. Cuantificación da expresión xénica	RNA-seq. Deseño experimental. Aliñamento RNA-seq. Cuantificación. Análise da expresión diferencial.
Tema 6. Ensamblaxe e anotación de xenomas	Ensamblaxe. Algoritmos Evaluación. Análisis de k-mers. Anotación de xenomas.
Tema 7. Análise metaxenómica	Microbioma. Metaxenómica Análise 16S. Análise shotgun. Diversidade alfa e beta. Anotación metaxenómica.